Protein–RNA interactions for Protein: A0A140T8N6

Trbv13-2, T cell receptor beta, variable 13-2 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-2A0A140T8N6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-2A0A140T8N6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-2A0A140T8N6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-2A0A140T8N6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-2A0A140T8N6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-2A0A140T8N6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-2A0A140T8N6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-2A0A140T8N6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-2A0A140T8N6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-2A0A140T8N6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trbv13-2A0A140T8N6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trbv13-2A0A140T8N6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trbv13-2A0A140T8N6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Trbv13-2A0A140T8N6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Trbv13-2A0A140T8N6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Trbv13-2A0A140T8N6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Trbv13-2A0A140T8N6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Trbv13-2A0A140T8N6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trbv13-2A0A140T8N6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trbv13-2A0A140T8N6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trbv13-2A0A140T8N6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trbv13-2A0A140T8N6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trbv13-2A0A140T8N6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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