Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms