Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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