Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms