Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ccdc18Q640L5 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ccdc18Q640L5 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ccdc18Q640L5 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ccdc18Q640L5 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ccdc18Q640L5 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ccdc18Q640L5 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ccdc18Q640L5 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ccdc18Q640L5 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ccdc18Q640L5 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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