Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ccndbp1Q3TVC7 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ccndbp1Q3TVC7 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ccndbp1Q3TVC7 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ccndbp1Q3TVC7 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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