Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Trim71Q1PSW8 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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