Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Rnf139Q7TMV1 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf139Q7TMV1 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf139Q7TMV1 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf139Q7TMV1 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf139Q7TMV1 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf139Q7TMV1 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Rnf139Q7TMV1 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Rnf139Q7TMV1 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf139Q7TMV1 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf139Q7TMV1 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Rnf139Q7TMV1 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Rnf139Q7TMV1 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf139Q7TMV1 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf139Q7TMV1 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf139Q7TMV1 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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