Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc18Q640L5 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms