Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim71Q1PSW8 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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