Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 B3galt5-202ENSMUST00000113800 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NischQ80TM9 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NischQ80TM9 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms