Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Serpina1a-202ENSMUST00000085056 1360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm22268-201ENSMUST00000104009 131 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm25607-201ENSMUST00000104020 127 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 Gm13254-201ENSMUST00000118295 654 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 Gm12354-201ENSMUST00000124319 554 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm12120-201ENSMUST00000125068 592 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 4930455G09Rik-201ENSMUST00000126231 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm5977-201ENSMUST00000174304 573 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 1110059E24Rik-202ENSMUST00000177577 599 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 Tmem265-202ENSMUST00000190278 587 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 Gm43218-201ENSMUST00000196275 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 2410137M14Rik-201ENSMUST00000039846 865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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GdnfP48540 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Olfr1198-202ENSMUST00000215179 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
GdnfP48540 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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