Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm37536-201ENSMUST00000194710 2491 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm15128-201ENSMUST00000112814 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Olfr601-202ENSMUST00000210431 2266 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Csf3r-202ENSMUST00000106162 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Osbpl1a-202ENSMUST00000117361 2687 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp9yF8VPU6 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms