Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Epn2-212ENSMUST00000178202 4317 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Trub1-202ENSMUST00000026073 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ikbkap-201ENSMUST00000030140 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mon2-203ENSMUST00000170935 5302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms