Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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PtprtQ99M80 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 AC122346.2-201ENSMUST00000224326 2931 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Supt7l-204ENSMUST00000201769 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm43071-201ENSMUST00000197233 2032 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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PtprtQ99M80 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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PtprtQ99M80 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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PtprtQ99M80 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Cul2-201ENSMUST00000025073 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprtQ99M80 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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