Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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