Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim17Q7TPM3 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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