Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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PtprdQ64487 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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PtprdQ64487 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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PtprdQ64487 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PtprdQ64487 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PtprdQ64487 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PtprdQ64487 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PtprdQ64487 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PtprdQ64487 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PtprdQ64487 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PtprdQ64487 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PtprdQ64487 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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PtprdQ64487 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PtprdQ64487 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprdQ64487 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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