Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Nt5c1b-202ENSMUST00000118657 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm40309-201ENSMUST00000202699 1752 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Tspan9-203ENSMUST00000112173 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm11901-201ENSMUST00000120412 437 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm34278-201ENSMUST00000220534 622 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Gpr1-201ENSMUST00000050536 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Ldlr-202ENSMUST00000213114 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Fanca-201ENSMUST00000035495 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Kif3c-204ENSMUST00000219895 2962 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 C6-201ENSMUST00000022788 2447 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Kprp-201ENSMUST00000072363 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Pilra-201ENSMUST00000058897 2578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc40-202ENSMUST00000053440 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Wnk4-201ENSMUST00000103108 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrc43Q3V0L5 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms