Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Traf3ip1Q149C2 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms