Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Prrt4B2RU40 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms