Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Stat2-202ENSMUST00000105238 4397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Rnf17Q99MV7 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rnf17Q99MV7 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rnf17Q99MV7 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rnf17Q99MV7 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Zmym5-203ENSMUST00000173954 5357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf17Q99MV7 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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