Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cdx4Q07424 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms