Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
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Sh3bp1P55194 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
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Sh3bp1P55194 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Sh3bp1P55194 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
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