Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm12178-201ENSMUST00000120545 330 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rpl37rt-202ENSMUST00000124641 294 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm12055-201ENSMUST00000143643 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rubie-201ENSMUST00000151828 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm45353-201ENSMUST00000210581 252 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Zfp637-211ENSMUST00000223041 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm15433-201ENSMUST00000097671 891 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm45790-201ENSMUST00000211986 1629 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr169-202ENSMUST00000215040 2316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Kif1b-201ENSMUST00000030806 6991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Trpm1-218ENSMUST00000206277 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Mkl1-201ENSMUST00000109579 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm36879-201ENSMUST00000212313 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 D7Ertd443e-203ENSMUST00000172947 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Ttll1-203ENSMUST00000109480 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 D630039A03Rik-201ENSMUST00000063816 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 1700034I23Rik-201ENSMUST00000099123 2348 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 CT009723.1-201ENSMUST00000215057 1803 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Kif9-201ENSMUST00000061155 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 B3galt5-202ENSMUST00000113800 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Btbd16-201ENSMUST00000048453 3434 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm15577-201ENSMUST00000144350 2293 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Opn1sw-201ENSMUST00000080428 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 4930524O08Rik-202ENSMUST00000184444 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Trav5-4-201ENSMUST00000103664 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm14648-201ENSMUST00000119328 483 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rpl21-ps15-201ENSMUST00000121545 483 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm9120-201ENSMUST00000190835 994 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm37432-201ENSMUST00000195294 341 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm9280-201ENSMUST00000223155 517 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rpl21-ps7-201ENSMUST00000077420 483 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms