Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Pard3b-203ENSMUST00000094906 7676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Slc5a6-205ENSMUST00000202520 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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