Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Kbtbd4-201ENSMUST00000090682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm28427-201ENSMUST00000190144 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm38072-201ENSMUST00000192127 2162 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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Dsg1bQ7TSF1 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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Dsg1bQ7TSF1 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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Dsg1bQ7TSF1 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr958-202ENSMUST00000215505 3514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
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