Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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