Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm2056J3QQ02 Gm4873-201ENSMUST00000199402 1203 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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