Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr6-202ENSMUST00000213552 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Fam212b-201ENSMUST00000066610 4701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms