Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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Tlr5Q9JLF7 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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Tlr5Q9JLF7 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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Tlr5Q9JLF7 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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Tlr5Q9JLF7 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Tlr5Q9JLF7 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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Tlr5Q9JLF7 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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Tlr5Q9JLF7 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Tlr5Q9JLF7 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms