Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Nalcn-201ENSMUST00000000201 7122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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