Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rnf17Q99MV7 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rnf17Q99MV7 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rnf17Q99MV7 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rnf17Q99MV7 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rnf17Q99MV7 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Rnf17Q99MV7 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Rnf17Q99MV7 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Rnf17Q99MV7 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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