Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl8Q9Z121 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms