Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cyp46a1Q9WVK8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp46a1Q9WVK8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms