Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scnn1bQ9WU38 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scnn1bQ9WU38 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms