Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtsjQ9R014 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsjQ9R014 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms