Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a3Q9QZS0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Col4a3Q9QZS0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Col4a3Q9QZS0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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