Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZN3

Fbxo8, F-box only protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo8Q9QZN3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fbxo8Q9QZN3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fbxo8Q9QZN3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fbxo8Q9QZN3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fbxo8Q9QZN3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fbxo8Q9QZN3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fbxo8Q9QZN3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms