Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnnt3Q9QZ47 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms