Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndrg3Q9QYF9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms