Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp1Q9QY53 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp1Q9QY53 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp1Q9QY53 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms