Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms