Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PdcQ9QW08 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdcQ9QW08 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms