Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcea2Q9QVN7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tcea2Q9QVN7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms