Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cln8Q9QUK3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms