Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm2bQ9JME9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms