Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc4apQ9JLV2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms