Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tlr5Q9JLF7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms