Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnot9Q9JKY0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms